Tiền thân của Công ty Cổ phần Nước sạch Bắc Ninh là Công ty Cấp thoát nước Bắc Ninh được thành lập theo Quyết định số 12/UB ngày 17/1/1997 của UBND tỉnh Bắc Ninh. Nhiệm vụ chủ yếu của Công ty là: Sản xuất và phân phối nước sạch; xây lắp hệ thống cấp thoát nước, điện cao hạ thế, nhà dân dụng và công nghiệp. Ngày 11/12/2006, UBND tỉnh Bắc Ninh ban hành Quyết định số 1063/OĐ-UBND.